Mithridates III là con trai và người kế vị của vua Mithridates II xứ Commagene với nữ hoàng Laodice. Ông có cả huyết thống [1] Armenia và Hy Lạp.

Khoảng sau năm 30 TCN, Mithridates III đã kết hôn với Iotapa, người em họ bên nội của mình, bà là một công chúa của xứ Media Atropatene và còn là con gái vua Artavasdes I của Media Atropatene với vợ ông, Athenais.

Iotapa đã sinh cho Mithridates III một người con gái, Aka II của Commagene;[2][3] một người con trai gọi là Antiochus III và hai người con gái khác đều được gọi là Iotapa. Một người con gái tên là Iotapa sau này kết hôn với vua Sampsiceramus II của Emesa, ở Syria và một Iotapa khác, sau đó kết hôn và cai trị cùng với người anh trai của bà là Antiochus III.

Khi người cha của Mithridates III qua đời vào năm 20 TCN, ông đã lên kế vị cha mình. Triều đại của ông kéo dài từ năm 20 TCN- năm 12 TCN. Rất ít điều được biết về cuộc đời và triều đại của ông. Khi ông qua đời vào năm 12 TCN, Antiochus III của Commagene đã lên ngôi vua.